利用生物素-亲合素系统的特征，可将蛋白质进行生物素化（即将蛋白质标记上生物素），与亲和素特异性结合，实现抗原抗体识别检测、生物大分子捕获、蛋白相互作用检测等目的。

通常可分为化学生物素化和Avitag-生物素化。
蛋白质生物素化的方法：
（1）将重组蛋白纯化后通过化学生物素标记法得到生物素化蛋白，通常利用生物素的羧基加以化学修饰可制成各种活性基团的衍生物，然后与重组蛋白质进行化学反应。
此种方法反应条件较为剧烈，一些相对敏感的蛋白容易失活，另外由于活化的生物素不具有识别特定蛋白质的能力，因而化学方法生物素化是非特异的。

（2)通过Avitag与重组蛋白融合表达，在体外把生物素标签进行生物素化，从而实现重组蛋白的生物素化。 这种特异性的定点修饰，对蛋白的活性影响小，产物专一，但是此种方法必须把目的蛋白与生物素标签进行融合表达，然后进行纯化得到高纯度的重组蛋白。

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