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氨基酸定制文库(Trimer、IUBcode、NNK)引物合成


Trimer引物——满足您对蛋白、抗体文库中特定位点氨基酸的多样性和偏好性需求

  • 可在突变位点处避免产生冗余突变和终止密码子
  • 根据氨基酸碱基密码进行设计,密码子与氨基酸一一对应
  • Trimer混合元件单元设计引物,可精准控制突变位点氨基酸比例

示例1

5GCAACTTATTACTGTCAGCAA(X)5-8CYGWTCACGTTCGGACAGGG3

X Trimers=Y(50%)/S (10%)/G(10%)/A(5%)/F(5%)/W(5%)/H(5%)/P(5%)/V(5%)


示例2

5YCAVCTTATTACTATCAGCAA(X)3-6CYGWTCACGTVSGGACAAAG3

X Trimers=A(30%)/S (20%)/W(15%)/Y(10%)/F(5%)/G(5%)/H(5%)/V(5%)/P(5%)


表1. Trimer与氨基酸对照表

IUBcode简并引物

通过混合2-4种碱基,核苷代码由单一的A、T、C、G拓展到R、Y、......N等11种混合核苷代码(IUB code,见表2)。使用IUB code构建不同的密码子组合,可以在突变位点形成固定氨基酸的组合。

表2. UBcode密码对照表

NNK简并引物

NNK简并密码子包含了32种密码子组合,覆盖了所有20种氨酸残基,是构建文库常用的简并密码子。


示例

5GGCCCTAACGGATAACCG(NNK)6GCCAATTCATGCACCTTACG3

N=A/C/G/T, K =G/T

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高通量突变引物合成 Trimer引物 1-3个月 请询价
IUBcode简并引物 8-10天
NNK简并引物 5-7天

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